O Žižkově mládí a vlastně o velké většině jeho života se dochovaly jen útržkovité zprávy. Sestavit z nich jakousi mozaiku celého životopisu je mimořádně obtížné. Jistý není ani rok jeho narození. Snad se narodil roku 1360, jak se často uvádí, ale není vůbec vyloučeno, že se tak stalo o jeden dva i více roků později.
Místem Žižkova narození byl s největší pravděpodobností jihočeský Trocnov. V něm měl Žižkův otec -patrně jménem Řehoř- svobodný statek/nebo snad dva?/ a snad i menší tvrz. Řehoř Žižka byl sice zemanem, tj. nižším šlechticem, ale jeho majetek byl rozsahem dost ubohý, srovnatelný s obyčejnými sedláky, ale naprosto nesrovnatelný s nejmocnějším jihočeským šlechtickým rodem Rožmberků. Přes ohromný majetek si právě Rožmberkové rádi své statky zaokrouhlovali na úkor drobných zemanů. I samotný Jan Žižka, který se správy trocnovského majetku ujal někdy kolem roku 1378 musel mocnému jihočeskému rodu nejednou čelit. Je dokonce možné, že se tak stalo již v době Žižkova dětství. Napovídal by k tomu fakt, že podle zkoumání jeho lebky moderními antropology musel být pozdější slavný vojevůdce na jedno oko slepý už od dětských let. Příčinou oslepnutí musela být vyloženě silná sečná rána do obličeje. /Že by přepadnutí Trocnova Rožmberky?/ V každém případě nemohl Žižka o první oko přijít, jak uvádí Jirásek ve svých ,,Starých pověstech českých“ až v roku 1410 v bitvě u Grunwaldu, pokud v ní vůbec bojoval.
Někdy v době kdy přejímal otcův statek se Jan Žižka i oženil. Jeho manželka-dívka z nedalekého Čeřejova se snad jmenovala Kateřina. Zda měli jedno či více/v některých pramenech se uvádějí tři/ dětí v tom se názory historiků liší. Bezpečně je prokázána pouze jedna dcera.
Dobrým hospodářem na rodném Trocnově Žižka patrně zrovna nebyl a v konkurenci s mocnými Rožmberky ani být nemohl. Půjčoval si peníze a poté i prodal část polností, které mu věnem přinesla žena. Ani to ale nepomohlo a jako hospodář Žižka během několika let zcela zkrachoval a přišel v podstatě o všechno. Byl sice stále nižším šlechticem, ale zústal mu vlastně jen erb s namalovaným rakem/nebo možná včelou/.
